Arcserveをアップグレードする際、バックアップエージェントを利用しているサーバーごとにアップグレードが必要ですか？

バックアップエージェントを利用しているサーバーごとにアップグレードが必要です。

Agent for Windowsでは、UDP（管理）コンソールからまとめてリモートインストールすることも可能です。

手順については、下記をご確認ください。

Arcserve構成ガイド - Arcserve UDP Version 6.0 から Version 6.5 へのアップグレード手順