Windows Server2012において、自社で保有しているOSライセンスをコンピュートリソース内で使用できますか？

使用できません。
ただし、お客様のご契約されているサービスが物理サーバーサービスもしくはコンピュートリソース（専用機器）であればお客様ライセンスをお持込いただけます。